Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPATO15228 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPATO15228 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPATO15228 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms