Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms