Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms