Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms