Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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