Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD8B2A6NJW9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms