Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms