Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ICE1Q9Y2F5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ICE1Q9Y2F5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ICE1Q9Y2F5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms