Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms