Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX6Q9UNH7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms