Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms