Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TPCN1Q9ULQ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPCN1Q9ULQ1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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