Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms