Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCAN3Q9UKA8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms