Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms