Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms