Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPN3Q9UHW5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms