Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms