Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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