Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT57Q9NWB7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms