Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms