Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms