Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms