Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPM3Q9HCF6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPM3Q9HCF6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms