Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms