Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms