Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms