Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDC3Q96F86 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms