Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms