Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPTQ96BT3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms