Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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DDB2Q92466 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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DDB2Q92466 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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