Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC117Q8IWD4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC117Q8IWD4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms