Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms