Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms