Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms