Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms