Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms