Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms