Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms