Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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