Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CA9Q16790 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CA9Q16790 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CA9Q16790 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CA9Q16790 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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