Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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