Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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