Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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