Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH1Q15438 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CYTH1Q15438 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CYTH1Q15438 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CYTH1Q15438 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms