Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms