Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CUL4AQ13619 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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