Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SEMA3FQ13275 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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