Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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