Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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